رزان حلاق^*(1)  ونعيم الحسين⁽¹⁾

(1) مركز البحوث العلمية الزراعية بحلب، الهيئة العامة للبحوث العلمية الزراعية، حلب، سورية.

(*للمراسلة الباحثة: رزان حلاق، البريد الإلكتروني: razanhalla@gmail.com)

الملخص
تعد أغنام العواس من أهم سلالات الأغنام في العالم، وتمتاز بصفات إنتاجية عالية في اللحم والحليب، ولأهمية إغناء الخريطة الوراثية بمؤشرات جديدة والبحث عن تعريف (بروفايل) مميز لهذه السلالة، فقد هدفت الدراسة إلى تطوير مؤشررات SSR وتوصيفها وظيفياً وتحديد موقعها الوراثي وتخصصها حاسوبياً عبر In-silico PCR. نُفّذت الدراسة في شعبة التقانات الحيويّة في مركز بحوث حلب خلال عام 2019، إذ حُلّل كامل التسلسل الجينومي لسلالة العواس Ovis aries Awassi حاسوبيّاً بدءاً من رصف التسلسلات المدروسة مع الجينوم المرجعي للأغنام لتحديد موقعها الوراثي، ورصفها مع قواعد بيانات البروتين لتوصيفها وظيفياً، واستُخرجت كافّة التكررات الترادفية البسيطة. حدّدت الدراسة الموقع الوراثي لـ 95.9% من التسلسلات المدروسة، ووصّفت التسلسلات الجينومية وظيفياً وحدّدت مواقع الـSSRs المرتبطة ببروتينات وظيفية، وبلغ عدد التسلسلات الموصفة وظيفياً والمسندة إلى مورثات معروفة 15.696 تسلسلاَ، وقد بينت الدراسة أن 962 SSR مرتبط ببروتين وظيفي وبموقع وراثي محدد, و524 SSR وظيفي بدون موقع وراثي محدد، إضافة إلى 61,824 SSR ذو موقع وراثي محدد ولم يرتبط بأي بروتين وظيفي، ووُصّف 53,214 تسلسلاً وظيفياً وحُدّدت مواقعها الوراثية دون ارتباطها بـSSRs وهي تمثل مصدراً هاماً للمؤشرات الأخرى، صُمّمت بادئات لـ 382 SSR معروفة الموقع الوراثي ومرتبطة ببروتين وظيفي، بينت نتائجها حاسوبياً عبر In-Silico PCR وجود 196 بادئة متخصصة أعطت ناتج تضخيم افتراضي وحيد، يمكن تجربتها مخبرياً على سلالات وأنواع قريبة قبل اعتمادها كمؤشرات خاصة بالمورثات الهامة واستخدامها في برامج التربية.
كلمات مفتاحية: أغنام، العواس، جينوم، توصيف وظيفي، معلوماتية حيوية.

البحث كاملاً باللغة العربية: pdf